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Flavie Lavoie-Cardinal

Professeure agrégée

Flavie.Lavoie-Cardinal@cervo.ulaval.ca
Centre de recherche en Robotique, Vision et Intelligence Machine
Centre thématique de recherche en neurosciences
Centre de recherche CERVO
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Contribution à la recherche

Axe de recherche de l'Université Laval :

Santé et bien-être durables

Thématiques de recherche de la Faculté de médecine :

Bioinformatique / données massives (big data)
Neurosciences et santé mentale

Domaines et intérêts de recherche du (de la) professeur(e) :

Neurosciences, santé mentale et toxicomanies
  • Activité nerveuse et synaptique
  • Communication neuronale et neurotransmission
  • Plasticité/régénération neuronale
  • Récepteurs et transporteurs
Subcellulaire
Outils de caractérisation
  • Imagerie
  • Structure moléculaire et conformation
Intelligence artificielle
  • Reconnaissance des formes et infographie
  • Systèmes experts
  • Systèmes neuronaux

Projets de recherche

  • Intelligent Nanoscopy of Cellular Plasticity - Instituts de recherche en santé du Canada - Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, chercheur principal - 2024-11-01 au 2029-10-31
  • Union Neurosciences et Intelligence Artificielle - Québec (UNIQUE) - Université Laval - Fonds internes, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies - Regroupements stratégiques NT, Université de Montréal, co-chercheur - 2022-04-01 au 2028-03-31
  • PandemicStop-AI: for an accelerated response to pandemics - Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements - Fonds de recherche biomédical du Canada (FRBC), Université de Montréal, co-chercheur - 2024-03-01 au 2028-03-31
  • Optical Nanoscopy of cytoskeletal and synaptic remodeling in neurons - Instituts de recherche en santé du Canada - Subvention Projet, co-chercheur - 2021-03-31 au 2027-03-31
  • Découverte d'antimicrobiens ciblant la biogenèse et la perméabilité de la membrane externe par microscopie à haut débit basée sur l'intelligence artificielle - Fonds de recherche du Québec - Santé - Programme bilatéral de recherche collaborative Québec - Communauté française de Belgique, Université de Montréal, co-chercheur - 2022-09-01 au 2025-08-31
  • Uncovering the nanoscale underpinnings of cognitive decline - Instituts de recherche en santé du Canada - Futurs leaders canadiens de la recherche sur le cerveau 2020, chercheur principal - 2023-09-01 au 2025-08-31
  • Enabling Identification and Impact of Synaptic Weight in Functional Networks - Fonds de recherche du Québec - Santé - Subvention d'équipe : Réseaux Next Generation Networks for Neuroscience, chercheur principal - 2020-07-01 au 2025-06-30
  • Repousser les frontières de l'étude de la biologie à l'échelle nanométrique en conditions naturelles - Fondation Canadienne pour l'innovation (La), CIUSSS - CN - CERVO, Ministère de la Santé et des Services sociaux - Fonds d'innovation (FI), chercheur principal - 2023-07-01 au 2025-03-31
  • Extreme zooming on intestinal permeability and the western-style diet: Unravelling the role of dietary antigens on the prevalence of cardiometabolic and mental health diseases in the North - Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements - Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs, chercheur principal - 2020-11-01 au 2024-12-31
  • The exposome-microbiota-brain axis under the microscope to tackle Environment-Health Interactions in the North - Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements - Sentinelle Nord - Deuxième appel à projets majeurs, co-chercheur - 2020-11-01 au 2024-12-31
  • Canada research chair in Intelligent Nanoscopy of Cellular Plasticity - Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada - Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, chercheur principal - 2019-11-01 au 2024-10-31
  • Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue - Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada - Supplément Tremplin vers la découverte, chercheur principal - 2019-04-01 au 2024-03-31
  • Pushing the boundaries of super-resolution optical microscopy for molecular imaging in live tissue - Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada - Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), chercheur principal - 2019-04-01 au 2024-03-31
  • Antimicrobial discovery by artificial intelligence-driven high-throughput microscopy - Génome Québec - Programme d’intégration de la génomique, Université de Montréal, co-chercheur - 2021-05-12 au 2023-06-30
  • Méthodes d'apprentissage automatique pour le développement de la microscopie intelligente des dynamiques cellulaires - Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies - Projet de recherche en équipe, chercheur principal - 2020-04-01 au 2023-03-31
  • Flashes of light: discovering rare brain events by combining astronomy and microscopy image analysis - Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements - Nouvelles frontières en recherche, chercheur principal - 2021-03-31 au 2023-03-30
  • Can Astronomy and Machine Learning help detect neurodegeneraion? - Institut canadien de recherches avancées, University of Toronto, co-chercheur - 2021-03-15 au 2023-03-15

Publications

  • Development of AI-assisted microscopy frameworks through realistic simulation with pySTED, Flavie Lavoie-Cardinal, Audrey Durand, Jörn Heine, Benoit Turcotte, Julia Chabbert, Albert Michaud-Gagnon, Anthony Bilodeau, Nature Machine Intelligence, 2024, 10.1038/s42256-024-00903-w
  • Development of AI-assisted microscopy frameworks through realistic simulation in pySTED, Flavie Lavoie-Cardinal, Audrey Durand, Jörn Heine, Benoit Turcotte, Julia Chabbert, Albert Michaud-Gagnon, Anthony Bilodeau, 2024, 10.1101/2024.03.25.586697
  • MICRA-Net: MICRoscopy Analysis Neural Network to solve detection, classification, and segmentation from a single simple auxiliary task, Flavie Lavoie-Cardinal, Audrey Durand, Paul De Koninck, Martin Parent, Constantin V.L. Delmas, Anthony Bilodeau, 2021, 10.1101/2021.06.29.448970
  • Nano-positioning and tubuline conformation determine transport of mitochondria along microtubules, P. Vanden Berghe, P. De Koninck, W. Boesmans, P. Verstreken, T. Martens, M. Decet, Y. Kazwiny, F. Lavoie-Cardinal, V. Van Steenbergen, 2020, 10.1101/2020.04.27.064766
  • Neuronal activity remodels the F-actin based submembrane lattice in dendrites but not axons of hippocampal neurons, Paul De Koninck, Christian Gagné, Gabrielle Laramée, Theresa Wiesner, Marc-André Gardner, Mado Lemieux, Anthony Bilodeau, Flavie Lavoie-Cardinal, 2020, 10.1101/2020.05.27.119453
  • Resolution enhancement with a task-assisted GAN to guide optical nanoscopy image analysis and acquisition, Flavie Lavoie-Cardinal, Christian Gagné, Benoît Turcotte, Anthony Bilodeau, Andréanne Deschênes, Theresa Wiesner, Catherine Bouchard, Nature Machine Intelligence, 2023, 10.1038/s42256-023-00689-3
  • Microscopy analysis neural network to solve detection, enumeration and segmentation from image-level annotations, Flavie Lavoie-Cardinal, Audrey Durand, Paul De Koninck, Martin Parent, Constantin V. L. Delmas, Anthony Bilodeau, Nature Machine Intelligence, 2022, 10.1038/s42256-022-00472-w

Contribution à l'enseignement aux cycles supérieurs

Étudiant(e)s dirigé(e)s*

Depuis 2009
  • Anthony Bilodeau - Doctorat - En cours
  • Alexis Lebrun - Doctorat - En cours
  • Frédéric Beaupré - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Owen Ferguson - Doctorat - En cours
  • William Leclerc - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Antoine Girard - Doctorat - En cours
  • Laurence-Taïsha Fontaine - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Alexy Pelletier-Rioux - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Laurence Descombes - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Catherine Bouchard - Doctorat - En cours
  • Kamylle Thériault - Maîtrise avec mémoire - En cours
  • Hadi Moazen - Doctorat - En cours
  • Andréanne Deschênes - Doctorat - En cours
  • Pierre-Luc Ayotte-Nadeau - Maîtrise avec mémoire - 2020/05
  • Louis-Emile Robitaille - Maîtrise avec mémoire - 2021/01
  • Theresa Wiesner - Doctorat - 2021/09
  • Vincent Boily - Maîtrise avec mémoire - 2023/05
  • Renaud Bernatchez - Maîtrise avec mémoire - 2024/01
  • Jean-Michel Bellavance - Maîtrise avec mémoire - 2024/01
  • Albert Michaud-Gagnon - Maîtrise avec mémoire - 2024/05
  • Benoît Turcotte - Maîtrise avec mémoire - 2024/05
  • Antoine Séverin Ollier - Maîtrise avec mémoire - 2024/09

Encadrement d'étudiant(e)s

Direction de recherche dans les domaines suivants :

  • Neurobiologie — Neurosciences

En savoir plus sur les programmes

Disponibilité d'encadrement d'étudiant(e)s

Ce (cette) professeur(e) est présentement à la recherche d'étudiant(e)s.

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*Les supervisions d’étudiant(e)s de 1er cycle en stage de recherche et de résident(e)s aux études médicales postdoctorales seront répertoriées ultérieurement.
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